Náplň činnosti ŠÚ stanovuje Smernica č.7/2004-E z 9. septembra 2004, ktorou sa určuje vzorová náplň činnosti obcí ako školských úradov a samosprávnych krajov zabezpečujúcich prenesený výkon štátnej správy na úseku školstva na orgány územnej samosprávy.
Školský úrad v Margecanoch pre školy a školské zariadenia, ktorých zriaďovateľom sú menované obce, vykonáva nasledovné činnosti :
- rozhoduje v druhom stupni vo veciach, v ktorých v prvom stupni rozhodol riaditeľ školy, ktorej je zriaďovateľom orgán územnej samosprávy,
- kontroluje dodržiavanie všeobecne záväzných právnych predpisov v oblasti výchovy a vzdelávania s výnimkou kontroly, ktorá je v pôsobnosti Štátnej školskej inšpekcie,
- vydáva organizačné pokyny pre riaditeľov škôl, ktorých je zriaďovateľom orgán územnej samosprávy a to najmä organizačné pokyny na príslušný školský rok,
- poskytuje odbornú a poradenskú činnosť školám a školským zariadeniam, ktorých zriaďovateľom je orgán územnej samosprávy.
Odborné činnosti v oblasti školstva zabezpečujú dvaja odborní zamestnanci, ktorí spĺňajú požiadavku odbornej a pedagogickej spôsobilosti:
Mgr. Ľudmila Mikolajová